微波杀菌要有三个阶段，阶段是迅速升温，达到预定杀菌温度，此段宜用较强的均匀能量密度；第二阶段是保温过程，使杀菌物料的温度处于均衡的过程，第三阶段是自然或强制冷却过程。
微波加热干燥、杀菌特点
加热迅速、均匀。不需热传导过程，它能在瞬间穿透到被加热物料中，穿透深度可达几厘米，休闲食品微波烘干箱，甚至十几厘米，甚至十几厘米，数秒到数分钟就能把微波转换为热能。微波具有选择加热，将使加热更均匀。
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微波的非热效应
微波的非热效应是指除热效应以外的其他效应，如电效应、磁效应及化学效应等．在微波电磁场的作用下，生物体内的一些分子将会产生变形和振动，使细胞膜功能受到影响，使细胞膜内外液体的电状况发生变化，四平微波烘干箱，引起生物作用的改变，粮食微波烘干箱，进而可影响神经系统等．微波干扰生物电(如心电、脑电、肌电、神经传导电位、细胞活动膜电位等)的节律，会导致心脏活动、脑神经活动及活动等一系列障碍．对微波的非热效应，人们还了解的不很多．当生物体受强功率微波照射时，热效应是主要的(一般认为，功率密度在在10mW／cm2者多产生微热效应．且频率越高产生热效应的阈强度越低)；长期的低功率密度(1m W／cm2 以下)微波辐射主要引起非热效应．
微波的热效应
微波对生物体的热效应是指由微波引起的生物组织或系统受热而对生物体产生的生理影响．热效应主要是生物体内有极分子在微波高频电场的作用下反复快速取向转动而摩擦生热；体内离子在微波作用下振动也会将振动能量转化为热量；一般分子也会吸收微波能量后使热运动能量增加．如果生物体组织吸收的微波能量较少，它可借助自身的热调节系统通过血循环将吸收的微波能量(热量)散发至全身或体外．如果微波功率很强，生物组织吸收的微波能量多于生物体所能散发的能量，则引起该部位体温升高．局部组织温度升高将产生一系列生理反应，如使局部血管扩张，并通过热调节系统使血循环加速，组织代谢增强，白细胞吞噬作用增强，促进病理产物的吸收和消散等．
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